Статья посвящена деятельности Межведомственного цента нанотехнологий "Томскнанотех", связанной с проведением мониторинга организаций наноиндустрии Сибири и Дальнего Востока. К таким организациям относятся организации, ведущие научные исследования в области нанотехнологий и наноматериалов, производящие нанопродукцию, обеспечивающие подготовку кадров в области нанотехнологий, осуществляющие финансирование проектов развития нанотехнологий, обеспечивающие развитие инфраструктуры и процесса коммерциализации технологий. В статье определены цели и задачи регионального центра мониторинга, описаны используемые методы сбора и анализа информации, приведены некоторые результаты изучения состояния и перспектив наноиндустрии, обозначены проблемы ее развития, а также сложности, возникающие в ходе выполнения процедуры мониторинга.